Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms