Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RANGAP1P46060 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms