Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms