Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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