Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR1AO95602 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms