Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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