Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTLL3Q9Y4R7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL3Q9Y4R7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms