Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D4Q9Y2X8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms