Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCA2Q9UQC9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLCA2Q9UQC9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms