Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCSK1NQ9UHG2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCSK1NQ9UHG2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 280.5 ms