Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ASF1BQ9NVP2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms