Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms