Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y4

GPN2, GPN-loop GTPase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN2Q9H9Y4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPN2Q9H9Y4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPN2Q9H9Y4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPN2Q9H9Y4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPN2Q9H9Y4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPN2Q9H9Y4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPN2Q9H9Y4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPN2Q9H9Y4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN2Q9H9Y4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN2Q9H9Y4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN2Q9H9Y4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN2Q9H9Y4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN2Q9H9Y4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN2Q9H9Y4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN2Q9H9Y4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN2Q9H9Y4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN2Q9H9Y4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN2Q9H9Y4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN2Q9H9Y4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN2Q9H9Y4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPN2Q9H9Y4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPN2Q9H9Y4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPN2Q9H9Y4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPN2Q9H9Y4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPN2Q9H9Y4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPN2Q9H9Y4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPN2Q9H9Y4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPN2Q9H9Y4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPN2Q9H9Y4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPN2Q9H9Y4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPN2Q9H9Y4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPN2Q9H9Y4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPN2Q9H9Y4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPN2Q9H9Y4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPN2Q9H9Y4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPN2Q9H9Y4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPN2Q9H9Y4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPN2Q9H9Y4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms