Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCL3Q9H2J4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDCL3Q9H2J4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms