Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO4Q9GZR2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
REXO4Q9GZR2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
REXO4Q9GZR2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REXO4Q9GZR2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REXO4Q9GZR2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REXO4Q9GZR2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REXO4Q9GZR2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REXO4Q9GZR2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms