Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFIH1Q9BYX4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFIH1Q9BYX4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIH1Q9BYX4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFIH1Q9BYX4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms