Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CENPOQ9BU64 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPOQ9BU64 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms