Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSY4

CHCHD5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD5Q9BSY4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD5Q9BSY4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms