Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms