Protein–RNA interactions for Protein: Q96PG1

MS4A4E, Putative membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4E, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4EQ96PG1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A4EQ96PG1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A4EQ96PG1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms