Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH12Q96NR8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms