Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDLIM2Q96JY6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms