Protein–RNA interactions for Protein: Q96FX2

DPH3, DPH3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPH3Q96FX2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DPH3Q96FX2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPH3Q96FX2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPH3Q96FX2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPH3Q96FX2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPH3Q96FX2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPH3Q96FX2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms