Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHISA4Q96DD7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SHISA4Q96DD7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms