Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms