Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAD50Q92878 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms