Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUFY2Q8WXA3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUFY2Q8WXA3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms