Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF398Q8TD17 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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