Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM71BQ8TC56 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM71BQ8TC56 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM71BQ8TC56 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM71BQ8TC56 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM71BQ8TC56 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM71BQ8TC56 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM71BQ8TC56 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM71BQ8TC56 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms