Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNF248Q8NDW4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF248Q8NDW4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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