Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.181e-7■■■■■ 30.6
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AGGF1Q8N302 CUL4A-211ENST00000498562 790 ntTSL 324.56■■□□□ 1.526e-10■■■■■ 30.6
AGGF1Q8N302 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.186e-10■■■■■ 30.6
AGGF1Q8N302 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.226e-10■■■■■ 30.6
AGGF1Q8N302 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.636e-10■■■■■ 30.6
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AGGF1Q8N302 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 30.6
AGGF1Q8N302 HS2ST1-203ENST00000591456 540 ntTSL 45.52□□□□□ -1.531e-7■■■■■ 30.6
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AGGF1Q8N302 ZFPM2-AS1-202ENST00000518932 649 ntTSL 28.12□□□□□ -1.117e-8■■■■■ 30.4
AGGF1Q8N302 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.147e-8■■■■■ 30.4
AGGF1Q8N302 ZFPM2-AS1-203ENST00000520078 500 ntTSL 27.86□□□□□ -1.157e-8■■■■■ 30.4
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AGGF1Q8N302 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.467e-8■■■■■ 30.4
AGGF1Q8N302 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.12e-7■■■■■ 30.4
AGGF1Q8N302 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.782e-7■■■■■ 30.4
AGGF1Q8N302 PRELID2-209ENST00000515475 582 ntTSL 425.33■■□□□ 1.652e-7■■■■■ 30.4
AGGF1Q8N302 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.222e-7■■■■■ 30.4
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AGGF1Q8N302 GTPBP6-202ENST00000485332 2016 ntTSL 219.42■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 30.4
AGGF1Q8N302 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 30.4
AGGF1Q8N302 TAF4-207ENST00000608887 284 ntTSL 48.17□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 30.4
AGGF1Q8N302 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.519e-9■■■■■ 30.4
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AGGF1Q8N302 LMNA-206ENST00000368300 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.369e-9■■■■■ 30.4
AGGF1Q8N302 PRKCB-210ENST00000498739 569 ntTSL 416.49■□□□□ 0.236e-8■■■■■ 30.3
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AGGF1Q8N302 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.255e-16■■■■■ 30.2
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AGGF1Q8N302 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.173e-29■■■■■ 30.1
AGGF1Q8N302 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.323e-29■■■■■ 30.1
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AGGF1Q8N302 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.164e-33■■■■■ 29.8
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AGGF1Q8N302 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.158e-9■■■■■ 29.7
AGGF1Q8N302 PRIMA1-204ENST00000477603 1081 ntTSL 1 (best)14.64□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 29.7
AGGF1Q8N302 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 29.7
AGGF1Q8N302 PRIMA1-202ENST00000393140 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.383e-7■■■■■ 29.7
AGGF1Q8N302 PRIMA1-203ENST00000393143 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.483e-7■■■■■ 29.7
AGGF1Q8N302 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 29.7
AGGF1Q8N302 CEP85L-206ENST00000434604 1797 ntTSL 1 (best)6.62□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 29.7
AGGF1Q8N302 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.822e-6■■■■■ 29.7
AGGF1Q8N302 APBB2-218ENST00000509475 1486 ntTSL 218.71■□□□□ 0.594e-9■■■■■ 29.7
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AGGF1Q8N302 APBB2-214ENST00000508593 3592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.444e-9■■■■■ 29.7
AGGF1Q8N302 APBB2-201ENST00000295974 8972 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.724e-9■■■■■ 29.7
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AGGF1Q8N302 APBB2-228ENST00000514094 856 ntTSL 49.17□□□□□ -0.944e-9■■■■■ 29.7
AGGF1Q8N302 APBB2-224ENST00000513140 4166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.014e-9■■■■■ 29.7
AGGF1Q8N302 APBB2-221ENST00000511120 560 ntTSL 48.45□□□□□ -1.064e-9■■■■■ 29.7
AGGF1Q8N302 APBB2-227ENST00000513611 2964 ntTSL 58.16□□□□□ -1.14e-9■■■■■ 29.7
AGGF1Q8N302 HECW1-209ENST00000490954 531 ntTSL 416.51■□□□□ 0.233e-8■■■■■ 29.6
AGGF1Q8N302 HECW1-210ENST00000492310 2186 ntTSL 214.16□□□□□ -0.143e-8■■■■■ 29.6
AGGF1Q8N302 FAT1-201ENST00000441802 14786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.924e-8■■■■■ 29.6
AGGF1Q8N302 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -14e-8■■■■■ 29.6
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