Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC13Q8IYE1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC13Q8IYE1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC13Q8IYE1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC13Q8IYE1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC13Q8IYE1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC13Q8IYE1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC13Q8IYE1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC13Q8IYE1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC13Q8IYE1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC13Q8IYE1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC13Q8IYE1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC13Q8IYE1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC13Q8IYE1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC13Q8IYE1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC13Q8IYE1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC13Q8IYE1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.2 ms