Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SV2BQ7L1I2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms