Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TBC1D9Q6ZT07 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TBC1D9Q6ZT07 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TBC1D9Q6ZT07 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TBC1D9Q6ZT07 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TBC1D9Q6ZT07 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TBC1D9Q6ZT07 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
TBC1D9Q6ZT07 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TBC1D9Q6ZT07 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms