Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL35Q6PF15 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms