Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXS1

PPP1R2P3, Protein phosphatase inhibitor 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R2P3Q6NXS1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R2P3Q6NXS1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP1R2P3Q6NXS1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R2P3Q6NXS1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R2P3Q6NXS1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R2P3Q6NXS1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R2P3Q6NXS1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R2P3Q6NXS1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R2P3Q6NXS1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R2P3Q6NXS1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R2P3Q6NXS1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R2P3Q6NXS1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R2P3Q6NXS1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R2P3Q6NXS1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R2P3Q6NXS1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R2P3Q6NXS1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R2P3Q6NXS1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R2P3Q6NXS1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms