Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CREB3L3Q68CJ9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms