Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEF1A1P5Q5VTE0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms