Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPEL1Q2QD12 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms