Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSR1Q2NL82 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR1Q2NL82 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms