Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3R2Q15599 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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