Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3AQ14563 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
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