Protein–RNA interactions for Protein: Q14141

SEPT6, Septin-6, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT6Q14141 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEPT6Q14141 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEPT6Q14141 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SEPT6Q14141 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEPT6Q14141 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEPT6Q14141 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEPT6Q14141 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEPT6Q14141 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT6Q14141 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT6Q14141 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT6Q14141 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT6Q14141 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT6Q14141 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT6Q14141 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT6Q14141 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT6Q14141 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT6Q14141 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT6Q14141 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT6Q14141 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT6Q14141 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEPT6Q14141 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEPT6Q14141 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEPT6Q14141 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEPT6Q14141 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEPT6Q14141 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEPT6Q14141 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEPT6Q14141 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEPT6Q14141 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEPT6Q14141 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEPT6Q14141 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEPT6Q14141 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEPT6Q14141 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEPT6Q14141 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEPT6Q14141 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEPT6Q14141 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms