Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP1A4Q13733 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP1A4Q13733 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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