Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL3Q13618 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL3Q13618 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms