Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPFIA1Q13136 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
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