Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBRQ0VD83 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBRQ0VD83 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBRQ0VD83 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBRQ0VD83 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBRQ0VD83 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBRQ0VD83 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBRQ0VD83 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBRQ0VD83 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBRQ0VD83 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBRQ0VD83 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBRQ0VD83 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBRQ0VD83 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBRQ0VD83 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBRQ0VD83 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBRQ0VD83 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
APOBRQ0VD83 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
APOBRQ0VD83 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
APOBRQ0VD83 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBRQ0VD83 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms