Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2orf54Q08AI8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.3 ms