Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP3CAQ08209 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms