Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNC4Q03721 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC4Q03721 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC4Q03721 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms